Het lichaam biologische cyclus worden gereguleerd door de hypothalamus, waarvan de vrijgave van serotonine regelt, die slaap induceert en epinefrine, die een selectedrende werking heeft. In migraine, door een storing in serotonineactiviteit, epinefrine release is slecht. Dit is de meest waarschijnlijke reden waarom de verstoring van de slaap kan leiden tot migraine.

De meest waarschijnlijke verklaring is hetzelfde als bij hypoglycemie (zie hierboven). Aantasting van het normale functioneren van de hersenen en het lichaam kan een stressreactie veroorzaken.

Het missen van een maaltijd kan leiden tot hypoglykemie (lage bloedsuikerspiegel). Men denkt dat hypoglycemie veroorzaakt door migraine veroorzaakt het vrijkomen van adrenaline en andere hormonen geassocieerd met de stress respons. Deze hormonen leiden tot een verhoging van de bloedsuikerspiegel. Geeft het lichaam vervolgens insuline om deze niveaus omlaag te brengen, die te veel kan vallen. Het eten van te veel koolhydraten heeft een soortgelijk effect, naast de verhoging van de bloedsuikerspiegel.

Gedurende de laatste twee weken van de menstruele cyclus, het niveau van oestrogeen (vrouwelijke hormonen) geleidelijk afneemt. Deze intrekking is rechtstreeks van invloed hersencel functie en kan een migraine-aanval. Tijdens de menopauze, een vrouw het lichaam produceert oestrogeen en progesteron (de geslachtshormonen verantwoordelijk voor de voortplanting) meer onregelmatig. De verstoorde oestrogeen kan leiden tot migraine. Na de menopauze, oestrogeen en progesteron niveaus zijn constant laag, vandaar migraine kunnen verbeteren.