Volumeverandering en verminderde activiteit bepaalde hersengebieden (abnormale interactie verschillende hersengebieden):

• Vergrote laterale ventrikels
• Volumeverlies frontaal- en temporaalkwab (langetermijn gevolg)
• Geringere omvang hippocampus (al aan begin stoornis aanwezig)
• Geringere omvang Basale-gangliasstructuren

Verminderde activiteit:

• Prefrontale cortex, (links (meer positief minder negatief affect)- verlaagt en rechts (meer negatief minder positief affect)-verhoogd) ook kwetsbaarheidfactor.
• Anterior cingulate cortex
• Amygdale, overactief resulteert in gedrukte stemming
• Hippocampus

Vooralsnog onduidelijk of neurale afwijkingen de depressie veroorzaken, tegelijkertijd met depressie optreden of het resultaat zijn van de depressie.

bilateraal voordeel (normale mensen) wordt gezien als bewijs samen-werking beide hemisferen. Voordeel niet bij schizofrenie men verondersteld gebrek aan samenwerking tussen hersenhelften. Oorzaak zou defect aan corpus callosum (hersenbalk verbinding links en rechts) zijn. Normaal is overdracht van rechts naar links sneller bij schizofrenie in beide richtingen hetzelfde langzame tempo (als van links naar rechts bij normale) symmetrie in overdracht kan ook duiden op gebrek aan functionele activiteit van rechterhemisfeer.