Heeft de BSG theorie alles over migraine verklaren?

Het probleem met de BSG theorie is dat het niet los van hoofdpijn ofwel verklaren andere symptomen van migraine, of waarom bepaalde milieu veranderingen leiden tot een migraine. Een andere theorie is dat migraine resultaat is van een afwijking in hoe hersencellen functioneren in de hersenstam, hypothalamus (een deel van de hersenen dat automatische lichaamsprocessen controles), en andere gebieden van de hersenen. Deze theorie is gebaseerd op de waarneming dat in die met migraine, hersencellen lijken hyperexciteerbare (overdreven reactie op stimulatie) zijn. Het is nog niet bekend of dit hyperexcitatie wordt veroorzaakt door een probleem met serotonine of dat er een probleem met betrekking tot genetische verschillen in de hersencellen zelf.